Историческая справка
Первая городская больница с аптекой при ней была открыта в Минусинске в 1889 году. Рассчитана она была на 36 коек. В первый год в больнице работали один врач и один фельдшер. Из 370 больных, принятых в больницу в течение первого года, умерло 23. Медицинскую помощь амбулаторным больным оказывали вольнопрактикующие врачи и повивальные бабки.
В Минусинском округе работал один окружной сельский врач, один фельдшер, окружная повивальная бабка и окружной врач судебной медицины.
В 1896 году открылась амбулаторная лечебница. Минусинский округ поделили на 7 врачебных участков с амбулаториями и тремя больничными койками.
В 1917 году в Минусинске работала уездно-городская больница на 40 коек. В 1924 году был открыт венерологический диспансер, а в 1925 году - малярийная станция. В 1926 году был организован противотуберкулезный пункт на 10 коек, а в 1928 году – серологическое отделение. Среди организаторов минусинского здравоохранения были Е.Н.Мартьянов, П.Н.Ксютин, С.Н.Боголюбов.
В 1941 году больница, именовавшаяся больницей имени 5-го Съезда Советов, имела 150 коек, в том числе 40 инфекционных, 20 детских, 45 терапевтических. Был там и изолятор для психических больных, рассчитанный на 5 коек. В 1944 году в штатном расписании больницы значилось уже 377 ставок, в том числе 45 врачебных. Более трехсот медицинских сестер подготовила за годы Великой Отечественной войны медицинская школа, открывшаяся в Минусинске в 1940 году.
1973-й год стал годом создания Минусинской центральной районной больницы. В палатах ее хирургического корпуса могли одновременно разместиться 350 больных.
В 2000 году структура минусинского здравоохранения претерпела реформирование. На основании совместного постановления администраций Минусинска и Минусинского района от 13.06.2000г, было создано управление здравоохранения города и района. В августе того же года начался процесс реорганизации лечебно-профилактических учреждений города в муниципальные учреждения здравоохранения, имеющие юридический статус.
Впоследствии в системе краевого здравоохранения появились управление здравоохранения Минусинска и управление здравоохранения Минусинского района.
В результате реорганизации всей системы краевого здравоохранения, в конце 2013 года на территории Красноярского края были упразднены все отделы и управления здравоохранения, а муниципальные лечебные учреждения получили статус краевых государственных бюджетных учреждений здравоохранения. МБУЗ "МЦРБ" преобразована в КГБУЗ "Минусинская межрайонная больница"
14 мая 2015 года в Единый государственный реестр юридических лиц внесена запись о создании юридического лица путём реорганизации в форме слияния Краевого государственного бюджетного учреждения здравоохранения «Минусинская межрайонная больница», КГБУЗ «Большеинская участковая больница», КГБУЗ «Знаменская участковая больница», КГБУЗ «Городокская участковая больница». В результате слияния перечисленные участковые больницы стали филиалами №1, №2, №3 КГБУЗ «Минусинская межрайонная больница»